Был учителем Джирайи, Орочимару и своей последовательницы Цунаде, которые известны как "три легендарных ниндзя". Во времена, когда Орочимару был студентом Сарутоби, последний смог оценить талант своего ученика и после получения титула Хокаге надеялся когда-нибудь передать именно ему это звание. Со временем он начинает замечать в ученике коварство, тщеславие и стремление возглавить деревню лишь с целью заполучить власть; после этого Сарутоби отказывается вверить ему свой пост, но продолжает верить в то, что Орочимару изменится.